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當(dāng)前位置:上海芃奇科學(xué)儀器有限公司>>技術(shù)文章>>Bioruptor Plus 非接觸式超聲破碎儀高效使用指南
水質(zhì)要求:僅可使用 2 級(jí) / 2 + 級(jí)去離子水或 3 級(jí)蒸餾水,嚴(yán)禁使用超純水和自來(lái)水。藻類、顆粒物等污染物會(huì)改變超聲波傳播路徑,導(dǎo)致片段分布不均,需至少每月更換一次水浴用水,并用軟紙巾清潔槽體內(nèi)壁,禁止使用硬質(zhì)清潔工具擦拭超聲發(fā)射面。
水溫控制:超聲處理的最佳水溫為 4℃,樣本溫度不得超過 10℃。水溫超過 8℃時(shí),超聲效率會(huì)顯著下降,且可能導(dǎo)致生物樣本熱變性。需搭配原廠冷水機(jī)與單循環(huán)閥維持溫度,冷水機(jī)必須安裝在超聲主機(jī)下方,保證水流循環(huán)正常;單循環(huán)閥可確保僅在超聲關(guān)閉階段更換水體,避免水流干擾超聲過程。
單次超聲總開啟時(shí)長(zhǎng)不得超過 30 分鐘,超聲關(guān)閉循環(huán)時(shí)長(zhǎng)需設(shè)置為大于或等于開啟循環(huán)時(shí)長(zhǎng),最小關(guān)閉時(shí)長(zhǎng)為 30 秒。
兩次獨(dú)立運(yùn)行之間,必須讓儀器冷卻至少 15 分鐘,避免超聲發(fā)射器過熱損壞。
無(wú)論使用何種規(guī)格的管架,必須始終裝滿離心管,空位需裝入等體積純水的離心管補(bǔ)齊,否則會(huì)導(dǎo)致能量分布不均,出現(xiàn)樣本破碎效果差異大的問題。
| 實(shí)驗(yàn)類型 | 輸出強(qiáng)度 | 標(biāo)準(zhǔn)循環(huán)參數(shù) | 核心調(diào)整依據(jù) |
|---|---|---|---|
| DNA 剪切 | 低功率(L 檔) | 30 秒開啟 / 90 秒關(guān)閉(常規(guī)片段);30 秒開啟 / 30 秒關(guān)閉(150bp 小片段) | 目標(biāo)片段大?。浩卧叫?,所需循環(huán)數(shù)越多(如 200bp 需 30 個(gè)循環(huán),750bp 需 3 個(gè)循環(huán)) |
| 染色質(zhì)剪切 | 高功率(H 檔) | 30 秒開啟 / 30 秒關(guān)閉,總循環(huán)數(shù) 10-30 個(gè) | 細(xì)胞類型與交聯(lián)程度:過度交聯(lián)的樣本需適當(dāng)增加循環(huán)數(shù),每 10 個(gè)循環(huán)需短暫渦旋離心樣本 |
| 細(xì)菌細(xì)胞破碎 | 高功率(H 檔) | 30 秒開啟 / 30 秒關(guān)閉,總超聲時(shí)長(zhǎng) 10 分鐘 | 細(xì)菌菌株:革蘭氏陽(yáng)性菌細(xì)胞壁較厚,可適當(dāng)延長(zhǎng)處理時(shí)間;對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)胞破碎效率高于穩(wěn)定期 |
DNA 剪切實(shí)驗(yàn):僅推薦使用 0.5ml Bioruptor 專用 DNA 剪切微量離心管(貨號(hào):C30010013),搭配 0.5ml 離心管架(貨號(hào):B01200043)。
染色質(zhì)剪切實(shí)驗(yàn):推薦使用 1.5ml TPX 微量離心管(貨號(hào):C30010010),其超聲傳導(dǎo)效率優(yōu)于普通聚丙烯離心管。
大體積樣本處理:10ml、15ml、50ml 離心管需使用帶金屬反射棒的專用管架,金屬棒通過共振系統(tǒng)反射超聲波,提升大體積樣本的處理效率。
濃度與體積控制:DNA 樣本推薦濃度為 1-20ng/μl,最佳濃度為 10ng/μl,樣本體積為 100μl;染色質(zhì)樣本每 300μl 裂解液中細(xì)胞數(shù)控制在 1×10^6-3×10^6 個(gè);細(xì)菌樣本重懸至 OD600=3.0,1.5ml 離心管中樣本體積不超過 300μl。
樣本預(yù)冷與混勻:超聲前需將樣本置于冰上預(yù)冷 10-15 分鐘,充分渦旋震蕩并短暫離心,將樣本收集至管底。高粘度樣本需多次吹吸混勻,避免局部濃度過高導(dǎo)致剪切不均。
樣本質(zhì)量把控:DNA 樣本需保證 OD260/280 比值在 1.8-2.0 之間,去除 RNA、蛋白等污染物;染色質(zhì)樣本需控制交聯(lián)時(shí)間在 8-10 分鐘,使用甘氨酸終止交聯(lián)反應(yīng),并用預(yù)冷 PBS 充分洗滌。
每次實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,排空水浴槽中的水,擦干槽體內(nèi)壁,避免滋生藻類或產(chǎn)生水垢。
每月檢查超聲發(fā)射器表面是否有劃痕或腐蝕,檢查電動(dòng)蓋子的齒輪盤轉(zhuǎn)動(dòng)是否順暢,避免電機(jī)過載。
每 20 次高壓滅菌后,檢查大體積管架的 O 型圈是否老化變形,及時(shí)更換損壞的 O 型圈。
定期使用原廠 DNA 質(zhì)控試劑盒對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行性能驗(yàn)證,通過檢測(cè) DNA 片段大小的變異系數(shù)評(píng)估超聲效率。
過熱停機(jī):若儀器提示溫度過高無(wú)法啟動(dòng)或運(yùn)行中自動(dòng)停機(jī),需立即停止操作,延長(zhǎng)冷卻間隔至 30 分鐘以上,可向水浴槽中加入碎冰輔助降溫,同時(shí)檢查冷水機(jī)運(yùn)行狀態(tài)和室溫是否符合要求。
剪切效果不均一:優(yōu)先檢查管架是否裝滿、離心管是否正確安裝,其次檢查水浴水質(zhì)和水溫,最后驗(yàn)證樣本濃度和離心管品牌是否符合要求。
超聲效率下降:可能是超聲發(fā)射器老化或水浴槽污染導(dǎo)致,需清潔水浴槽并更換新的去離子水,若問題仍未解決,聯(lián)系授權(quán)服務(wù)中心進(jìn)行檢測(cè)。
固定離心管品牌和型號(hào),更換耗材前需重新優(yōu)化實(shí)驗(yàn)參數(shù)。
所有實(shí)驗(yàn)保持相同的水浴溫度、超聲強(qiáng)度和循環(huán)參數(shù),避免隨意調(diào)整。
對(duì)于新的樣本類型,先進(jìn)行時(shí)間梯度預(yù)實(shí)驗(yàn),確定最佳處理?xiàng)l件后再進(jìn)行正式實(shí)驗(yàn)。
采用統(tǒng)一的樣本檢測(cè)方法,使用新鮮配制的 1% 瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),上樣量不超過 5μg,樣本提前用 RNase 處理,避免干擾檢測(cè)結(jié)果。
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